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- pdb文件如何打开？ - 知乎
在对PDB（ pdb）文件进行操作时，有时仅需要保留蛋白链、核酸链、配体、或者水。 除了直接在文本文档格式下或者coot中对PDB文件中其他信息进行删除，还可以通过命令行的形式来提取，这种方法简便且不改变原PDB文件，避免出现误操作的情况。
- pymol如何保存成pdb格式? - 知乎
pdb格式 图片取自：pdbintro 其次，我们需要知道Pymol中显示颜色的方式。Pymol有各种显示颜色的方案，我们这次会利用其能够根据b-factor上色的功能。 Pymol操作为：color选项 >> spectrum >> b-factors 我们第一步要生成一个9x9x9的格子。
- 有谁在RCSB PDB网站下载过蛋白质的pdb文件？怎样从这个网站中下载到某一聚合物中某一个组成部分的pdb文件？ - 知乎
有谁在RCSB PDB网站下载过蛋白质的pdb文件？ 怎样从这个网站中下载到某一聚合物中某一个组成部分的pdb文件？ 例如由actin何frofilin两种蛋白质通过binding 形成complex,能不能找到complex中actin的pdb文件 关注者 10
- 如何获得一个蛋白质的PDB编号？ - 知乎
问题不清楚：我理解你的问题是 1）我想知道一个 蛋白质 的 空间结构，想查查pdb，但是不知道编号。 这个好办，不需要知道 pdb编号。直接查蛋白质的名字，其他通用的ID就行了。一个蛋白质，视重要程度和实验难度，可能有从几个到上千又或者根本没有结构信息，所以蛋白质和pdb是一对多的关系
- pdb是什么文件格式? - 知乎
在最基本的层面上， PDB 文件是原子和笛卡尔 (XYZ) 坐标的列表。相同的格式可用于表示任何物理对象。包含其他信息以提供有关原子的更多详细信息，以及将原子构建成氨基酸、将氨基酸（残基）构建成蛋白质以及将蛋白质构建成大分子。跳过第一列，第二列是顺序原子数。接下来，是原子符号
- 在数据库中蛋白质结构搜索？ - 知乎
怎么在PDB数据库里搜索人的C-Met蛋白结构
- 从 Alphafold 蛋白质结构数据库下载 PDB文件 - 知乎
如何从 alphafold2 蛋白质数据库下载 pdb。AlphaFold 是由谷歌的 DeepMind 开发的人工智能程序，用于预测蛋白质结构。 网址：https
- pdb蛋白库如何搜索想要的蛋白质？ - 知乎
将蛋白质pdb与 适配体pdb 对接时会出现报错，提示蛋白质pdb有问题，我是在RCSB网站下载的蛋白pdb，是需要进行什么处理，才能在用于对接的时候不报错吗？
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